特殊化學染色

※PAS (Periodic Acid Schiff) Stain / PAS染色法

原理是透過過碘酸把糖類相鄰兩個碳上的烴基氧化成醛基，再用Schiff試劑和醛基反應使呈現紫紅色，因此可以用來檢測組織中的糖類。

※Masson’s Trichrome Stain / Masson三色染色法

主要可以將膠原纖維collagen fibers和肌肉纖維muscle fibers 差異染色。

Collagen和軟骨cartilage 會呈現藍色或綠色，肌肉纖維、纖維素和紅血球會染成紅色，細胞核會染成藍黑色。

※Modified Movat's Pentachrome

觀察胃粘膜epithelial metaplasia 其中glycogen 和mucous substance型態的變化。酸性黏液呈現藍色，中性黏液為紅色，混合黏液則是紫色，細胞核為淡藍色。

※Verhoeff–Van Gieson (VVG) stain

此染色會和彈性蛋白形成多種陽離子、陰離子和非離子鍵，彈性蛋白為彈性纖維的主要成分，染劑會與彈性纖維具有強親和力，脫色後，彈性纖維的顏色可以被留著，利用硫代硫酸鈉洗去多餘的碘。

最後彈性纖維為藍黑色至黑色，膠原蛋白會被染成紅色，其他組織則會染成黃色。

※Picro-Sirius Red Stain / 天狼星紅

Picrosirius red 染劑為強酸性染劑，會與膠原分子中的鹼性基團結合。

可以用來觀察冠狀動脈粥狀硬化，血管壁內膜增厚，軟骨與硬骨的膠原纖維，在偏光鏡的顯微鏡下可以觀察到不同種類的膠原蛋白，細膠原纖維可以看到綠色到綠黃色，粗膠原纖維會看到黃色、橘色到紅色。

※Oil Red O   / 油紅染色

常被用於觀察細胞是否分化脂肪細胞及組織細胞內油滴積狀況等應用

※Toluidine blue Stain / 甲苯胺藍

對核酸具有高親和力，對具有高DNA和RNA的組織結合。在一些癌症，過敏性癌症疾病或腸胃道疾病，肥大細胞跟患者的狀況可能會需要了解肥大細胞之間的關係。可以將細胞核染成深藍色，肥大細胞跟多糖染成紫色。肥大細胞存在結締組織中，他們的細胞質含有肝素和組織胺組成的顆粒。

※Alcian blue Stain / 阿爾辛藍

用於觀察組織中的弱硫酸化和羧化酸性粘多醣(sulfated and carboxylated acid)、 硫酸化和羧化唾液粘多糖蛋白(mucopolysaccharides and sulfated and carboxylated sialomucins (glycoproteins)。

※Safranin O Stain / 番紅染色

是軟骨形成的指標，為一種陽離子染劑，可以觀察軟骨中的酸性蛋白多醣。可用於檢測軟骨，黏蛋白和肥大細胞。軟骨和粘蛋白將被染成橙色至紅色，並且細胞核將染成黑色。背景染成藍綠色。

※Alizarin Red S / 茜素紅

主要能觀察骨細胞增殖分化和骨組織為成骨的潛能，能與鈣離子產生橘紅色的沈澱物，用來觀察鈣沉積或組織鈣化的狀況。

※Nissl stain / 尼氏染色